玉米赤霉烯酮对猪小肠上皮细胞转录组和染色质可及性的影响

这篇文章主要想研究非编码RNA与染色质可及性对玉米赤霉烯酮对猪小肠上皮细胞的影响,思路较简单,分析也过于简单,文章也没有得到特定的结论。思路如下图b所示,分析ATAC-seq得到peaks,然后注释peaks的基因,分析RNA-seq得到miRNA,lncRNA,然后预测这些非编码RNA的靶基因,并将非编码RNA的靶基因与peak注释到的基因整合,进行功能注释。

题目:transcriptome and chromatin accessibility in porcine intestinal epithelial cells upon Zearalenone exposure

杂志:Scientific DATA

时间:Dec 3, 2019

链接: https://doi.org/10.1038/s41597-019-0313-1