多组学数据联合展示、且可以交互的基因组浏览器——trackViewer

常见的可视化基因组track的Bioconductor package有rtracklayerGviz。rtracklayer提供了交互的基因组浏览器和相关tracks的注释;Gviz可以用于tracks覆盖度和注释的可视化。trackViewer是一个更轻量级的工具,且可以产生交互的可视化结果。可用于RNA-seq,ChIP-seq/ATAC-seq,miRNA-seq,DNA-seq,methylation等各种NGS组学数据的覆盖度和注释tracks的可视化展示,而且可以绘制发表级的棒棒糖图和蒲公英图。

先展示下极好看可视化效果

使用方法可以参考文档: