在HIV-1耐药性预测中利用交叉耐药信息的多标签分类方法

文章信息

题目:Multilabel classification for exploiting cross-resistance information in HIV-1 drug resistance prediction

杂志:Bioinformatics (Sequence Analysis)

IF: 5.610 (2019)

时间:June 21, 2013

链接:doi:10.1093/bioinformatics/btt331

一句话评价

多标签分类算法

文章介绍

概述

耐药性是疾病治疗中面临的一个重要难题。很多细菌或病毒还经常出现交叉耐药现象。不仅导致了当前治疗大的某一药物产生耐药性,而且对未使用的药物也产生耐药性。因此,耐药性的自动分类和预测在临床研究上具有重要的意义。而机器学习虽然已广泛用于抗药性研究,但是多重交叉耐药的信息还有待研究。

方法

数据

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IC50 ratio: 这里与药物的抗性相关,IC50 ratio cutoff是每个药物定义为抗性的临界值。

多标签分类

分类器链(Classification Chains, CC)

CC的组合

结果和结论

(简要,理顺逻辑)

创新性和意义

(思路,方法或者数据资源对自己有什么启示)