摘要-单细胞多组学揭示混合表型急性白血病的恶性调控特征

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单细胞多组学联合分析急性白血病的恶性调控特征

文章信息

题目：A single cell framework for multi-omic analysis of disease identifies malignant regulatory signatures in mixed phenotype acute leukemia

杂志：bioRxiv

时间：Jul. 9, 2019

链接: DOI: http://dx.doi.org/10.1101/696328

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文章介绍：

单细胞转录组和表观组的整合方法示例，通过比较正常样本和疾病样本转录组和表观组的差异，鉴定调控疾病发生特征。这里以混合表型急性白血病（mixed phenotype acute leukemia，MPAL)为例。首先从健康的外周血和骨髓单个核细胞建立造血发育的免疫表型、转录组和表观遗传学单细胞图。同时在一组混合表型急性白血病（MPAL）临床样本中，从单个细胞中鉴定出癌症特异性转录和染色质特征。测序方法包括droplet-based CITE-seq (single-cell antibody derived tag and RNA sequencing) 和 scATAC-seq (single-cell chromatin accessibility profiling),以及scRNA-seq和scADT-seq（antibody derived tag sequencing）

碎碎念

借助技术和方法的创新，William J. Greenleaf1对造血系统的正常发育和异常疾病的研究可真多。

每日文献摘要：第8篇 2019年09月27日 周五