细菌生物信息资源数据库——PATRIC

PATRIC https://www.patricbrc.org/ :即病理系统资源整合中心,提供了集成的数据资源和分析工具,以支持有关细菌感染性疾病的生物医学研究。

PATRIC, the Pathosystems Resource Integration Center, provides integrated data and analysis tools to support biomedical research on bacterial infectious diseases.

下面是该网站主页,主要包含3个模块:

  • 第一个是搜索模块,可以对细菌、古细菌、噬菌体以及真核宿主进行搜索,数据包括基因组、基因、转录组实验、分类学等信息;
  • 第二个是数据分析模块,可以进行基因组组装、注释、RNA-seq、代谢组的分析等
  • 第三个是多组学数据资源,如AMR数据,基因组数据,蛋白质家族,特殊基因等数据资源