一句话评价
胰腺导管癌(PDAC)异质性和恶性发展的单细胞研究
文章信息
题目：Single-cell RNA-seq highlights intra-tumoral heterogeneity and malignant progression in pancreatic ductal adenocarcinoma
杂志：Cell Research
时间：04 July 2019
链接: https://www.nature.com/articles/s41422-019-0195-y
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文章介绍：
利用单细胞RNA-seq技术对胰腺导管癌的肿瘤内部异质性和恶性发展进行探究。样本量包括24个肿瘤样本和11个对照样本，利用droplet建库的方法，得到57,530个细胞。主要分析包括：首先对细胞进行1）分群，鉴定到10个群，其中有2个导管细胞型群分别具有异常和恶性基因表达特征，然后又对两个导管细胞群进行亚群分析。2）细胞轨迹分析（拟时间分析）揭示了PDAC恶性发展过程中的相关的通路和转录因子。3）免疫浸润分析：结合TCGA胰腺癌相关的公共数据发现了肿瘤浸润T细胞失活状态相关的基因，为肿瘤免疫治疗提供了参考靶点。
碎碎念
细胞分群是单细胞数据分析的常规步骤
拟时间分析这里用于探究肿瘤恶性程度的发展值得借鉴
另外如何从拟时间分析得到了相关的转录因子呢？（细看原文）
最后与肿瘤免疫扯上关系，升华了研究的价值和意义
每日文献摘要：第1篇 2019年08月24日 周六