摘要-scRNA-seq探究人胰腺转录组图谱

一句话评价

人胰腺单细胞转录组图谱

文章信息

题目:A Single-Cell Transcriptome Atlas of the Human Pancreas

杂志:Cell Systems

时间:October 26, 2016

链接: http://dx.doi.org/10.1016/j.cels.2016.09.002

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文章介绍:

利用scRNA-seq对人胰腺的组成进行分群以及鉴定特定细胞群的标记基因。样本来自4个过亡的捐赠者,scRNA-seq采用CEL-Seq2 protocol结合FACS分选和机器学技术。所做的分析包括两个方面,首先利用StemID算法对细胞分群,然后鉴定特定细胞亚群的标记基因和转录因子。主要结果有:鉴定到CD24TM4SF4可以作为alpha 和beta 细胞的标记基因。

碎碎念

  1. 只进行了分群和细胞标记基因的鉴定,所做的分析很少,可以利用该数据进行进一步的挖掘
  2. 数据资源:GSE85241提供了表达矩阵

每日文献摘要:第2篇 2019年08月25日 周日