一句话评价
一个基于深度卷积神经网络分析低覆盖度和低质量ATAC-seq的工具
文章信息
题目：AtacWorks: A deep convolutional neural network toolkit for epigenomics
杂志：bioRxiv
时间：Nov. 4, 2019
链接: doi: http://dx.doi.org/10.1101/829481.
文章介绍：
这篇文章介绍了一个基于深度卷积神经网络的方法解析低覆盖度或低质量ATAC-seq数据的工具包——AtacWorks 。使用的架构是Resnet (residual neural network) 。训练模型的数据来自4个血细胞类型，之后利用得到的模型分析HSC，鉴定了差异调控元件、转录因子印迹。
工具介绍：https://github.com/clara-genomics/AtacWorks
安装方法：
流程：
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碎碎念
还看不懂深度学习的算法，一些基本概念都不理解
每日文献摘要：第20篇 2019年11月23日 周六