利用深度学习进行宏基因组物种分类

一句话评价

深度学习在宏基因组分析的物种鉴定中的应用

文章信息

题目:DeepMicrobes: taxonomic classification for metagenomics with deep learning

杂志:BioRxiv

时间:Jul,8, 2019

链接: http://dx.doi.org/10.1101/694851

文章介绍:

物种分类是宏基因组分析中重要的一个环节,虽然有很多相关的工具。但是利用深度学习的框架进行物种鉴定分类的报道还相对较少,作者这里基于recurrent neural network的架构开发了DeepMicrobes用于物种分类研究,与其他工具相比发现DeepMicrobes的假阳性率相对较低。

软件地址:https://github.com/MicrobeLab/DeepMicrobes

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每日文献摘要:第21篇 2019年11月25日 周一