利用多组学数据预测药物组合的驱动网络标记物

文章介绍:

药物组合不仅可能同时抑制多种肿瘤的驱动信号通路,而且有可能减少药物抵抗性。这篇文章介绍了一个利用多组学数据开发的工具——DrugComboExplorer,鉴定药物组合的驱动信号通路,并预测药物组合的协同作用。

该工具通过处理来自单个癌症患者的DNA测序、基因拷贝数、DNA甲基化和RNA序列数据,使用整合的算法(包括bootstrap aggregating-based Markov random field,WGCNA,监督调控网络学习)流程产生驱动信号网络。

DrugComboExplorer is available at https://github.com/Roosevelt- PKU/drugcombinationprediction.

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文章信息

题目:Driver network as a biomarker: systematic integration and network modeling of multi-omics data to derive driver signaling pathways for drug combination prediction

杂志:Bioinformatics,

时间:15 February 2019

链接: doi: 10.1093/bioinformatics/btz109

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