深度卷积神经网络分析低质量的ATAC-seq数据

发表于 2019-11-23 | 分类于 literature |

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一句话评价

一个基于深度卷积神经网络分析低覆盖度和低质量ATAC-seq的工具

文章信息

题目：AtacWorks: A deep convolutional neural network toolkit for epigenomics

杂志：bioRxiv

时间：Nov. 4, 2019

链接: doi: http://dx.doi.org/10.1101/829481.

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scATAC-seq与scRNA-seq的整合分析系统——MAESTRO

发表于 2019-11-23 | 分类于 Data Sciences |

字数统计: 399 | 阅读时长 ≈ 1

单细胞技术是目前比较火热的一个领域，从单细胞转录组、基因组扩展到单细胞表观组，如scATAC-seq, scHiC, scmethylation等，促使着相关的分析工具也不断涌出。单细胞领域相关工具的开发大致有两个方向：一是从本质上如算法、统计学方法入手开发新的分析工具；一种是整合多种基础工具，开发出具有功能全面，易用等特征的工具。