摘要-scRNAseq探究健康人胰岛和T2D的转录组图谱

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健康人胰岛和T2D的单细胞转录组图谱

文章信息

题目：Single-Cell Transcriptome Profiling of Human Pancreatic Islets in Health and Type 2 Diabetes

杂志：Cell Metabolism

时间：October 11, 2016

链接: http://dx.doi.org/10.1016/j.cmet.2016.08.020

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文章介绍：

利用单细胞RNA技术探究健康人胰岛和T2D的转录组图谱。数据来源于6个健康人和4个T2D病人，利用SMRT2-seq的方法得到2,209个单细胞。主要分析包括对1）细胞分群；2）鉴定alpha 和beta细胞亚群 ；3）肥胖或T2D相关基因与BMI的关联；4）T2D的基因变异

碎碎念

  1. 与16年发表在Cell systerm上的文章相比，这篇文章的分析相对丰富些，一是数据即包括健康人胰腺又包括糖尿病，二是不仅对细胞进行了分群和标记物的鉴定，还将T2D基因和肥胖基因与BMI关联，以及通过与正常组比较发现了T2D的基因变异。将健康和疾病的对照研究，凸显了鉴定的靶标具有重要的临床意义。

  2. Rickard Sandberg实验室发表的文章，SMRT-seq2的开发者，分析方法可以学习

  3. 数据资源：E-MTAB-5061， E-MTAB-5060

每日文献摘要：第3篇 2019年08月26日 周一