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scRNA-seq最佳实践分析教程

发表于 2019-09-20 | 分类于 Data Sciences |
字数统计: 347 | 阅读时长 ≈ 1

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scRNA-seq目前最佳实践分析教程

文章信息

题目:Current best practices in single-cell RNA-seq analysis: a tutorial

杂志:Molecular systems biology

时间:Jul. 13, 2019

链接: doi: http://dx.doi.org/10.1101/701680

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摘要-单细胞空间转录组整合分析和可视化流程_Giotto

发表于 2019-09-20 | 分类于 literature |
字数统计: 646 | 阅读时长 ≈ 2

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单细胞空间转录组分析和可视化流程

文章信息

题目:Giotto, a pipeline for integrative analysis and visualization of single-cell spatial transcriptomic data

杂志:bioRxiv

时间:Jul. 13, 2019

链接: doi: http://dx.doi.org/10.1101/701680

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肿瘤基质边界的酸性微环境与肿瘤迁徙

发表于 2019-08-30 | 分类于 literature |
字数统计: 363 | 阅读时长 ≈ 1

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酸性环境改变转录组的变化影响肿瘤的恶性发展

文章信息

题目:Acidification of Tumor at Stromal Boundaries Drives Transcriptome Alterations Associated with Aggressive Phenotypes

杂志:Cancer research

时间:April 15, 2019

链接: DOI: 10.1158/0008-5472.CAN-18-1604

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scATAC的一篇经典文献-研究人细胞发育和肿瘤内T细胞耗竭

发表于 2019-08-26 | 分类于 literature |
字数统计: 369 | 阅读时长 ≈ 1

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学习scATAC-seq的必读文献

文章信息

题目:Massively parallel single-cell chromatin landscapes of human immune cell development and intratumoral T cell exhaustion

杂志:Nature biotechnology

时间:August, 2019

链接: https://www.nature.com/articles/s41587-019-0206-z

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awk基本命令使用

发表于 2019-08-25 | 分类于 Data Sciences |
字数统计: 667 | 阅读时长 ≈ 2

awk是一个处理文本文件的程序,也是一门强大的编程语言。awk是把文件逐行的读入,以空格为默认分隔符将每行分割,切开的部分再进行各种分析处理,非常适用于每行格式相同的文本文件。

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